Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Kcnip3Q9QXT8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnip3Q9QXT8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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