Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cml5Q9QXS8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms