Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rad18Q9QXK2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad18Q9QXK2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms