Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChmQ9QXG2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChmQ9QXG2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms