Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms