Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms