Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma6Q9QUM9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms