Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl2Q9QUK0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms