Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sfmbt1Q9JMD1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms