Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms