Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rabgef1Q9JM13 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rabgef1Q9JM13 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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