Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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Tmod4Q9JLH8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod4Q9JLH8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Tmod4Q9JLH8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Tmod4Q9JLH8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Tmod4Q9JLH8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod4Q9JLH8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod4Q9JLH8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Tmod4Q9JLH8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod4Q9JLH8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Tmod4Q9JLH8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Tmod4Q9JLH8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod4Q9JLH8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod4Q9JLH8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod4Q9JLH8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod4Q9JLH8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod4Q9JLH8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod4Q9JLH8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod4Q9JLH8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod4Q9JLH8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod4Q9JLH8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod4Q9JLH8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod4Q9JLH8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod4Q9JLH8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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