Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmx1aQ9JKU8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmx1aQ9JKU8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms