Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms