Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ap4m1Q9JKC7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4m1Q9JKC7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms