Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms