Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ59

Abcb9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb9Q9JJ59 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcb9Q9JJ59 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms