Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip1Q9JJ57 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip1Q9JJ57 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip1Q9JJ57 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip1Q9JJ57 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip1Q9JJ57 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Kcnip1Q9JJ57 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Kcnip1Q9JJ57 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms