Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc22Q9JIG7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc22Q9JIG7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms