Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2ird1Q9JI57 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms