Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EefsecQ9JHW4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EefsecQ9JHW4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms