Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem27Q9ESG4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms