Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc4Q9ES56 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc4Q9ES56 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms