Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc28a3Q9ERH8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc28a3Q9ERH8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc28a3Q9ERH8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc28a3Q9ERH8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc28a3Q9ERH8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc28a3Q9ERH8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc28a3Q9ERH8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc28a3Q9ERH8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc28a3Q9ERH8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc28a3Q9ERH8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc28a3Q9ERH8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc28a3Q9ERH8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms