Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap29Q9ERB0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snap29Q9ERB0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms