Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SgshQ9EQ08 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SgshQ9EQ08 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms