Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r53Q9EP93 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r53Q9EP93 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms