Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3fQ9DCH4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms