Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Xab2Q9DCD2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xab2Q9DCD2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms