Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc97Q9DBT3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms