Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp27a1Q9DBG1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp27a1Q9DBG1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp27a1Q9DBG1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp27a1Q9DBG1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp27a1Q9DBG1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp27a1Q9DBG1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Cyp27a1Q9DBG1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp27a1Q9DBG1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms