Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Smg9Q9DB90 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Smg9Q9DB90 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg9Q9DB90 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg9Q9DB90 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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