Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms