Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd8Q9DA37 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms