Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efhc1Q9D9T8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhc1Q9D9T8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms