Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms