Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms