Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc91Q9D8L5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc91Q9D8L5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc91Q9D8L5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc91Q9D8L5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc91Q9D8L5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc91Q9D8L5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc91Q9D8L5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc91Q9D8L5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc91Q9D8L5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc91Q9D8L5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc91Q9D8L5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc91Q9D8L5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc91Q9D8L5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc91Q9D8L5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms