Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Alkbh4Q9D8F1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms