Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arpc5lQ9D898 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc5lQ9D898 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms