Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2310002L09RikQ9D7L5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
2310002L09RikQ9D7L5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
2310002L09RikQ9D7L5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms