Protein–RNA interactions for Protein: Q9D799

Mtfmt, Methionyl-tRNA formyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtfmtQ9D799 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MtfmtQ9D799 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MtfmtQ9D799 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms