Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms