Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms