Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W6

Slco6d1, MCG6225, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6d1Q9D5W6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco6d1Q9D5W6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco6d1Q9D5W6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slco6d1Q9D5W6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slco6d1Q9D5W6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slco6d1Q9D5W6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms