Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D5Q8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9D5Q8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms