Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc130Q9D516 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms