Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc83Q9D4V3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms