Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms