Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K4

Fancd2os, FANCD2 opposite strand protein, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fancd2osQ9D4K4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fancd2osQ9D4K4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms